Here is a list of all documented functions with links to the documentation:

- a -

• add_refl() : reflist.h
• add_refl_to_list() : reflist.h
• add_symop() : symmetry.h
• assplode() : utils.h
• asymmetric_indices() : reflist-utils.h

- c -

• calculate_partialities() : geometry.h
• cell_free() : cell.h
• cell_get_volume() : cell-utils.h
• cell_has_parameters() : cell.h
• cell_new() : cell.h
• cell_rotate() : cell-utils.h
• cell_transform_intmat() : cell.h
• cell_transform_intmat_inverse() : cell.h
• cell_transform_rational() : cell.h
• cell_transform_rational_inverse() : cell.h
• check_list_symmetry() : reflist-utils.h
• compare_cell_parameters() : cell-utils.h
• compare_cell_parameters_and_orientation() : cell-utils.h
• compare_derivative_cell_parameters() : cell-utils.h
• compare_permuted_cell_parameters_and_orientation() : cell-utils.h
• compare_reindexed_cell_parameters() : cell-utils.h
• copy_data() : reflist.h
• copy_reflist() : reflist-utils.h
• crystal_copy() : crystal.h
• crystal_free() : crystal.h
• crystal_new() : crystal.h

- d -

• data_template_get_2d_detgeom_if_possible() : datatemplate.h
• data_template_get_clen_if_possible() : datatemplate.h
• data_template_get_wavelength_if_possible() : datatemplate.h
• data_template_rotate_group() : datatemplate.h
• data_template_slabby_file_to_panel_coords() : datatemplate.h
• data_template_translate_group_m() : datatemplate.h
• data_template_translate_group_px() : datatemplate.h
• describe_symmetry() : symmetry.h

- f -

• find_refl() : reflist.h
• first_refl() : reflist.h
• first_refl_const() : reflist.h
• fom_calculate() : fom.h
• fom_make_resolution_shells() : fom.h
• fom_overall_num_possible() : fom.h
• fom_overall_num_reflections() : fom.h
• fom_overall_value() : fom.h
• fom_select_reflection_pairs() : fom.h
• fom_select_reflections() : fom.h
• fom_shell_centre() : fom.h
• fom_shell_num_possible() : fom.h
• fom_shell_num_reflections() : fom.h
• fom_shell_value() : fom.h
• forbidden_reflection() : cell-utils.h
• free_contribs() : reflist-utils.h
• free_symoplist() : symmetry.h
• free_symopmask() : symmetry.h

- g -

• get_ambiguities() : symmetry.h
• get_asymm() : symmetry.h
• get_contributions() : reflist.h
• get_detector_pos() : reflist.h
• get_equiv() : symmetry.h
• get_esd_intensity() : reflist.h
• get_exerr() : reflist.h
• get_flag() : reflist.h
• get_indices() : reflist.h
• get_intensity() : reflist.h
• get_khalf() : reflist.h
• get_kpred() : reflist.h
• get_lattice_symmetry() : cell-utils.h
• get_lorentz() : reflist.h
• get_mean_bg() : reflist.h
• get_panel_number() : reflist.h
• get_partiality() : reflist.h
• get_peak() : reflist.h
• get_phase() : reflist.h
• get_pointgroup() : symmetry.h
• get_redundancy() : reflist.h
• get_symmetric_indices() : reflist.h
• get_symop() : symmetry.h
• get_temp1() : reflist.h
• get_temp2() : reflist.h

- i -

• image_create_for_simulation() : image.h
• indexing_peak_check() : peaks.h
• intmat_copy() : integer_matrix.h
• intmat_create_3x3() : integer_matrix.h
• intmat_det() : integer_matrix.h
• intmat_equals() : integer_matrix.h
• intmat_free() : integer_matrix.h
• intmat_get() : integer_matrix.h
• intmat_identity() : integer_matrix.h
• intmat_inverse() : integer_matrix.h
• intmat_is_identity() : integer_matrix.h
• intmat_is_inversion() : integer_matrix.h
• intmat_new() : integer_matrix.h
• intmat_print() : integer_matrix.h
• intmat_set() : integer_matrix.h
• intmat_size() : integer_matrix.h
• intmat_times_intmat() : integer_matrix.h
• is_centric() : symmetry.h
• is_centrosymmetric() : symmetry.h
• is_subgroup() : symmetry.h

- l -

• load_cell_from_file() : cell-utils.h
• load_cell_from_pdb() : cell-utils.h
• lock_reflection() : reflist.h
• lowest_reflection() : cell-utils.h

- m -

• max_intensity() : reflist-utils.h

- n -

• new_symopmask() : symmetry.h
• next_found_refl() : reflist.h
• next_refl() : reflist.h
• next_refl_const() : reflist.h
• normalise_quaternion() : utils.h
• num_equivs() : symmetry.h
• num_reflections() : reflist.h

- p -

• parse_cell_transformation() : symmetry.h
• parse_symmetry_operations() : symmetry.h
• peakfinder8() : peakfinder8.h
• predict_to_res() : geometry.h

- q -

• quat_rot() : utils.h
• quaternion_modulus() : utils.h
• quaternion_valid() : utils.h

- r -

• random_quaternion() : utils.h
• read_reflections() : reflist-utils.h
• read_reflections_2() : reflist-utils.h
• read_reflections_3() : reflist-utils.h
• reflection_free() : reflist.h
• reflection_new() : reflist.h
• reflist_add_notes() : reflist.h
• reflist_free() : reflist.h
• reflist_get_notes() : reflist.h
• reflist_new() : reflist.h
• res_cutoff() : reflist-utils.h
• resolution_limits() : reflist-utils.h
• rotate_cell() : cell-utils.h
• rtnl_format() : rational.h
• rtnl_mtx_new() : rational.h
• rtnl_mtx_print() : rational.h
• run_threads() : thread-pool.h

- s -

• set_contributions() : reflist.h
• set_detector_pos() : reflist.h
• set_esd_intensity() : reflist.h
• set_exerr() : reflist.h
• set_flag() : reflist.h
• set_intensity() : reflist.h
• set_khalf() : reflist.h
• set_kpred() : reflist.h
• set_lorentz() : reflist.h
• set_mean_bg() : reflist.h
• set_panel_number() : reflist.h
• set_partiality() : reflist.h
• set_peak() : reflist.h
• set_phase() : reflist.h
• set_redundancy() : reflist.h
• set_symmetric_indices() : reflist.h
• set_symmetry_name() : symmetry.h
• set_temp1() : reflist.h
• set_temp2() : reflist.h
• show_matrix() : utils.h
• show_matrix_eqn() : utils.h
• solve_svd() : utils.h
• sort_peaks() : image.h
• special_position() : symmetry.h
• spectrum_free() : spectrum.h
• spectrum_generate_gaussian() : spectrum.h
• spectrum_generate_sase() : spectrum.h
• spectrum_generate_tophat() : spectrum.h
• spectrum_generate_twocolour() : spectrum.h
• spectrum_get_density_at_k() : spectrum.h
• spectrum_get_gaussian() : spectrum.h
• spectrum_get_num_gaussians() : spectrum.h
• spectrum_get_range() : spectrum.h
• spectrum_load() : spectrum.h
• spectrum_new() : spectrum.h
• spectrum_set_gaussians() : spectrum.h
• spectrum_set_pdf() : spectrum.h
• stream_close() : stream.h
• stream_open_fd_for_write() : stream.h
• stream_open_for_write() : stream.h
• stream_read_chunk() : stream.h
• stream_rewind() : stream.h
• stream_write_chunk() : stream.h
• stream_write_commandline_args() : stream.h
• stream_write_data_template() : stream.h
• stream_write_geometry_file() : stream.h
• symmetry_name() : symmetry.h

- t -

• transform_indices() : integer_matrix.h
• tree_depth() : reflist.h

- u -

• uncenter_cell() : cell-utils.h
• unlock_reflection() : reflist.h
• update_predictions() : geometry.h

- v -

• validate_cell() : cell-utils.h

- w -

• write_cell() : cell-utils.h
• write_reflist() : reflist-utils.h
• write_reflist_2() : reflist-utils.h